Un nouveau coronavirus associé à une maladie respiratoire humaine en Chine.

Résumé (abstract PubMed)

Les maladies infectieuses émergentes, telles que le syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS) et la maladie à virus Zika, représentent une menace majeure pour la santé publique. Malgré d'intenses efforts de recherche, la manière dont, le moment où et l'endroit où de nouvelles maladies apparaissent demeurent encore une source d'incertitude considérable. Une maladie respiratoire sévère a récemment été signalée à Wuhan, dans la province du Hubei, en Chine. Au 25 janvier 2020, au moins 1 975 cas avaient été rapportés depuis l'hospitalisation du premier patient le 12 décembre 2019. Les investigations épidémiologiques ont suggéré que l'épidémie était associée à un marché de produits de la mer à Wuhan. Nous étudions ici un patient unique qui était un employé de ce marché et qui a été admis à l'Hôpital Central de Wuhan le 26 décembre 2019 alors qu'il présentait un syndrome respiratoire sévère incluant de la fièvre, des vertiges et une toux. Le séquençage métagénomique de l'ARN d'un échantillon de liquide de lavage bronchoalvéolaire prélevé sur le patient a permis d'identifier une nouvelle souche de virus à ARN appartenant à la famille des Coronaviridae, désignée ici sous le nom de coronavirus « WH-Human 1 » (également désigné sous le nom de « 2019-nCoV »). L'analyse phylogénétique du génome viral complet (29 903 nucléotides) a révélé que le virus était le plus étroitement apparenté (89,1 % de similarité nucléotidique) à un groupe de coronavirus apparentés au SRAS (genre Betacoronavirus, sous-genre Sarbecovirus) qui avaient précédemment été découverts chez des chauves-souris en Chine. Cette épidémie met en lumière la capacité persistante du débordement viral depuis les animaux à provoquer des maladies sévères chez l'être humain.